沿革
現在の部屋は、1955年（昭和30年）5月場所限りで引退した二所ノ関部屋（大関・佐賀ノ花）所属の元小結・琴錦が年寄・佐渡ヶ嶽を襲名して、数名の内弟子を連れて二所ノ関部屋から分家独立して佐渡ヶ嶽部屋を創設した。11代佐渡ヶ嶽は、横綱・琴櫻、大関・琴ヶ濱、関脇・長谷川らを育てたが、1974年（昭和49年）7月場所中に急逝した。
11代佐渡ヶ嶽が死去したため、1974年（昭和49年）7月場所前に引退して年寄・白玉を襲名したばかりの琴櫻が佐渡ヶ嶽に名跡変更して佐渡ヶ嶽部屋を継承した。12代佐渡ヶ嶽は、精力的に弟子のスカウト活動に力を注ぎ、佐渡ヶ嶽を一躍大部屋に拡大した。そして、先代からの弟子である琴風を大関に育てるとともに、幕内最高優勝を飾った関脇・琴富士、関脇・琴錦、大関・琴光喜をはじめ幕内力士を多数輩出した。
12代佐渡ヶ嶽が2005年（平成17年）11月場所13日目（11月25日）に停年退職を迎えたため、娘婿の元関脇・琴ノ若が13日目の取組をもって引退し、年寄・佐渡ヶ嶽を襲名して佐渡ヶ嶽部屋を継承。直後に先代からの弟子である琴欧洲が大関に昇進、2007年には年来の大関候補である琴光喜もそれに続いた。[1]12代はその後13代ら家族に看取られ病没。琴光喜の昇進伝達式に立ち会ったわずか20日後であった。
2006年（平成18年）6月に琴欧洲を筆頭に13人の所属力士がイスラエル外務省の招きで同国を訪れ、親善相撲を行った。
佐渡ヶ嶽部屋所属力士には「琴」の字が頭に付いた「琴○○」[2]の四股名が付いているが、これは11代佐渡ヶ嶽（琴錦）の故郷・観音寺にある琴弾八幡宮に由来している。本名で土俵に上がる場合でも、本名の前に「琴」の字を付けて四股名を作るのが通例である（例として琴光喜が初土俵時に名乗った琴田宮。ただし、例外的に元関脇長谷川には「琴」の文字がつかなかった）。
また、佐渡ヶ嶽部屋は、1965年（昭和40年）1月場所から完全部屋別総当たり制度が導入されたが、その時に幕内力士をだしていた部屋で、唯一その後幕内力士を絶やしたことが無い。
2009年（平成21年）9月場所現在、大関・琴欧洲が部屋頭である。